अणुओं की संरचना बहुत महत्वपूर्ण है क्योंकि इससे यह जानकारी मिलती है कि अणु अन्य यौगिकों के साथ कैसे संपर्क करेगा। आकार यौगिकों को हिमांक बिंदु, क्वथनांक, अस्थिरता, पदार्थ अवस्था, सतह तनाव, चिपचिपापन और बहुत कुछ निर्धारित करता है। 3 डी मॉडल में एक यौगिक संरचना को समझना बहुत आसान है। विभिन्न बांडों के अलग-अलग कोण होते हैं और यौगिक में अलग-अलग तत्वों को अलग-अलग रंगों द्वारा दर्शाया जाता है। एक यौगिक में अधिक तत्व और बांड अधिक उन्नत और यौगिक संरचना की ज्यामिति को जटिल करते हैं।
लुईस डॉट संरचना का उपयोग करके चुने हुए अणु की संरचना बनाएं। लेविस डॉट संरचना मुख्य तत्वों, वैलेंस इलेक्ट्रॉनों की संख्या और यौगिकों को केंद्रीय यौगिक से जोड़ते हैं।
प्रत्येक मुख्य परिसर के चारों ओर आवश्यक कोणों को निर्धारित करें। एक यौगिक जिसमें चार बॉन्ड होते हैं, एक टेट्राहेड्रल व्यवस्था में बॉन्ड 109.5 डिग्री के अलावा होगा। एक त्रिकोणीय प्लानर व्यवस्था में तीन बांड 120 डिग्री से अलग हो जाते हैं। मुख्य परिसर से दो बंधन रैखिक व्यवस्था में हैं और 180 डिग्री से अलग हो गए हैं।
स्टायरोफोम गेंदों को उपयुक्त रंग पेंट करें। कार्बन के लिए स्टायरोफोम बॉल्स समान रंग होंगे, ऑक्सीजन स्टायरोफोम बॉल्स एक और रंग और हाइड्रोजन बॉल्स एक अतिरिक्त रंग होंगे। परिसर में जितने अधिक तत्व होंगे उतने अधिक रंगों की आवश्यकता होगी।
बॉल्स को पॉप्सपिक स्टिक या पाइप क्लीनर से कनेक्ट करें। संरचना को सही करने के लिए यौगिक के बंधन कोणों का उपयोग करें। सिंगल बॉन्ड के लिए एक पाइप क्लीनर, डबल बॉन्ड दो पाइप क्लीनर और ट्रिपल बॉन्ड तीन पाइप क्लीनर की आवश्यकता होती है। मजबूत कनेक्शनों के लिए स्टायरोफोम गेंदों में डालने से पहले पाइप क्लीनर के सिरों पर कुछ गोंद लगाएं।