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ग्राम दाग एक अंतर धुंधला प्रक्रिया है जो यह दर्शाता है कि कौन से बैक्टीरिया ग्राम-पॉजिटिव हैं या उनके दाग के रंग के आधार पर ग्राम-नकारात्मक हैं। इस प्रक्रिया में रंग की भिन्नता प्रदान करने के लिए एसीटोन अल्कोहल का उपयोग किया जाता है। ग्राम पॉजिटिव बैक्टीरिया में एक मोटी पेप्टीडोग्लाइकन परत और दाग बैंगनी होता है, जबकि ग्राम-नकारात्मक सूक्ष्मजीवों में थोड़ा सा पेप्टीडोग्लाइकन परत और दाग गुलाबी होता है।
प्राथमिक दाग-क्रिस्टल वायलेट
बैक्टीरिया के नमूने की एक स्लाइड तैयार करने के बाद, पहले नमूने को दागने के लिए क्रिस्टल वायलेट का उपयोग किया जाता है। इस बिंदु पर ग्राम-पॉजिटिव और ग्राम-नकारात्मक बैक्टीरिया दोनों बैंगनी दिखाई देंगे। आमतौर पर क्रिस्टल वायलेट को पानी से किसी भी अतिरिक्त दाग को धोने से पहले 30 सेकंड के लिए स्लाइड पर लगाया जाता है। क्रिस्टल वायलेट पेप्टिडोग्लाइकन परतों के लिए थोड़ा पालन कर सकता है, इसलिए सभी प्राथमिक दाग पानी से धोया नहीं जाएगा।
कटु-आयोडीन
आयोडीन को फिर एक मिनट के लिए नमूने में जोड़ा जाता है। यह एक मोर्डेंट के रूप में कार्य करता है, जो एक धुंधला प्रक्रिया में रंजक को ठीक करने का कार्य करता है। आयोडीन इस कार्य को क्रिस्टल वायलेट के साथ बांधकर और एक अघुलनशील परिसर का निर्माण करता है, जो केवल क्रिस्टल वायलेट की तुलना में ग्राम पॉजिटिव बैक्टीरिया कोशिकाओं में पाए जाने वाले मोटी पेप्टिडोग्लाइकन परत के लिए बहुत बेहतर पालन करता है। आयोडीन जोड़ने के बाद पानी से धोने का कदम नहीं है।
Decolorizer-शराब
या तो एसीटोन या एथिल अल्कोहल का उपयोग डिकॉजिंग एजेंट के रूप में किया जा सकता है। अल्कोहल ग्राम-नकारात्मक बैक्टीरिया की बाहरी कोशिका झिल्ली में पाए जाने वाले लिपिड को भंग कर देता है, जिससे क्रिस्टल वायलेट-आयोडीन कॉम्प्लेक्स को पतले पेप्टाइडोग्लाइकन परत से बाहर लीक करने की अनुमति मिलती है। शराब 10 से 20 सेकंड के लिए जोड़ा जाता है; यह स्लाइड पर डाला जाता है जब तक कि सभी आयोडीन धुल न जाएं और रन-ऑफ बेरंग हो। ग्राम दाग प्रक्रिया में इस बिंदु पर, ग्राम-नकारात्मक बैक्टीरिया रंगहीन होते हैं, जबकि ग्राम-पॉजिटिव बैक्टीरिया अभी भी क्रिस्टल वायलेट को बनाए रखते हैं। एक बार खत्म होने के बाद स्लाइड को पानी के साथ रिंस करने की जरूरत होती है ताकि डीकॉर्फ़ाइजिंग प्रभाव को रोका जा सके।
Counterstain-सैफरैनीन
Safranin तो रंगहीन ग्राम नकारात्मक बैक्टीरिया के लिए दृश्यता और इसके विपरीत बढ़ाने के लिए जोड़ा जाता है। दाग इन बैक्टीरिया को माइक्रोस्कोप के नीचे गुलाबी दिखाई देता है। चूंकि पूरे नमूने में दाग जोड़ा जाता है, इसलिए यह ग्राम-पॉजिटिव बैक्टीरिया को भी दाग देता है, लेकिन क्रिस्टल वायलेट का गहरा लाइटर सफारी गुलाबी रंग को छिपा देता है। एक बार स्लाइड के नमूने को लगभग एक मिनट के लिए सफ़रनिन से भर दिया गया था, पानी का उपयोग किसी भी अतिरिक्त दाग को धोने के लिए किया जाता है जो बैक्टीरिया कोशिकाओं का पालन नहीं करता था।