विषय
विभिन्न प्रकार के धुंधला होने पर प्रमुख प्रकार के बैक्टीरिया को पारंपरिक रूप से शारीरिक विशेषताओं या प्रतिक्रियाओं द्वारा वर्गीकृत किया गया था। आणविक आनुवंशिकी के आगमन ने बैक्टीरिया के विभिन्न समूहों के अधिक सावधान विभाजन की अनुमति दी है। कई वैज्ञानिकों का मानना है कि बैक्टीरिया के पुराने वर्गीकरण को दो या अधिक राज्यों में विभाजित किया जाना चाहिए।
राज्यों
जीवित चीजों का उच्चतम वर्गीकरण राज्यों है। बैक्टीरिया को एक बार प्रोटिस्टा नामक एक राज्य में वर्गीकृत किया गया था, लेकिन कई वैज्ञानिकों का तर्क है कि पुराने राज्य को आणविक आनुवंशिक प्रमाण के आधार पर दो राज्यों में विभाजित किया जाना चाहिए। नए राज्य सच्चे जीवाणु, यूबैक्टेरिया और प्राचीन बैक्टीरिया, आर्कबैक्टेरिया होंगे, जो आज चरम वातावरण में जीवित हैं। कुछ लोग सुझाव देते हैं कि एक नया फ़ाइलोजेनेटिक डिवीजन जिसे डोमेन या सुपरकिंगडोम के रूप में जाना जाता है, क्योंकि आर्कबैक्टीरिया बहुत अलग हैं, उन्हें अपने स्वयं के तीन राज्यों में विभाजित किया जा सकता है: Crenaripleota, थर्मोफिलिक बैक्टीरिया; यूरीआर्कोटा, हेलोफिलिक और मेथेनोजेनिक बैक्टीरिया; और कोररपोरटोटा, गर्म झरनों में पाया जाता है।
Phylums
आर्कबैक्टेरिया के अलावा अन्य जीवाणुओं के लिए, पांच अलग-अलग फ़ाइलेम्स हैं, अगली शाखा फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ है। प्रोटियोबैक्टीरिया पौधों के साथ सहजीवी होते हैं और उन्हें वायुमंडल से नाइट्रोजन को ठीक करने में मदद करते हैं। सायनोबैक्टीरिया को नीले-हरे बैक्टीरिया के रूप में जाना जाता है। यूबैक्टीरिया पारंपरिक रूप से वर्गीकृत ग्राम पॉजिटिव बैक्टीरिया होते हैं और इनमें सेल की दीवारें होती हैं जिनकी अन्य बैक्टीरिया की तुलना में अलग-अलग परतें होती हैं। स्पाइरोकैट्स सर्पिल कॉलोनियों में बढ़ते हैं। क्लैमाइडिया इंट्रासेल्युलर परजीवी हैं।
पारंपरिक वर्गीकरण
बैक्टीरिया को रोगजनक (बीमारी पैदा करने वाला) या गैर-रोगजनक के रूप में वर्णित किया जा सकता है। उन्हें ग्राम-सकारात्मक या ग्राम-नकारात्मक के रूप में भी वर्णित किया जा सकता है। यह संदर्भित करता है कि वे ग्राम धुंधला द्वारा डाई को अवशोषित करते हैं या नहीं। ग्राम पॉजिटिव बैक्टीरिया में एक बाहरी कोशिका झिल्ली की कमी होती है, और पेप्टिडोग्लाइकेन्स उन्हें क्रिस्टल वायलेट के साथ दागने की अनुमति देते हैं। ग्राम-नकारात्मक बैक्टीरिया में एक बाहरी कोशिका झिल्ली होती है, लेकिन पेप्टिडोग्लाइकेन्स की कमी होती है, जिससे उन्हें दाग होने से रोका जाता है।