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आमतौर पर आपकी कोशिकाओं के अंदर प्रत्येक डीएनए अणु में हाइड्रोजन बांड नामक इंटरैक्शन द्वारा दो स्ट्रैंड एक साथ जुड़ते हैं। हालाँकि, स्थितियों में परिवर्तन डीएनए को "अस्वीकृत" कर सकता है और इन किस्में को अलग कर सकता है। NaOH जैसे मजबूत आधारों को जोड़ना, नाटकीय रूप से पीएच को बढ़ाता है, इस प्रकार समाधान के हाइड्रोजन आयन सांद्रता को कम करता है और दोहरे-फंसे डीएनए को बदनाम करता है।
पीएच का प्रभाव
हाइड्रॉक्साइड आयन एकाग्रता और पीएच का सीधा संबंध है, जिसका अर्थ है उच्च पीएच, उच्च हाइड्रोक्साइड सांद्रता। इसी तरह, हाइड्रोजन आयन की सघनता कम हो जाती है। उच्च पीएच में, फिर, समाधान हाइड्रॉक्साइड आयनों में समृद्ध है, और ये नकारात्मक चार्ज आयन डीएनए में आधार जोड़े की तरह अणुओं से हाइड्रोजन आयनों को खींच सकते हैं। यह प्रक्रिया हाइड्रोजन बॉन्डिंग को बाधित करती है जो दो डीएनए स्ट्रैंड को एक साथ रखती है, जिससे वे अलग हो जाते हैं।
आरएनए बनाम डीएनए
आरएनए के विपरीत, डीएनए में प्रत्येक शर्करा समूह में 2 स्थान पर एक हाइड्रॉक्सिल समूह का अभाव होता है। यह अंतर क्षारीय समाधान में डीएनए को अधिक स्थिर बनाता है। आरएनए में, 2 स्थिति पर हाइड्रॉक्सिल समूह उच्च पीएच में समाधान के लिए एक हाइड्रोजन आयन को छोड़ सकता है, जिससे एक अत्यधिक प्रतिक्रियाशील एल्कोक्साइड ऑयन बनता है जो दो पड़ोसी न्यूक्लियोटाइड को एक साथ रखने वाले फॉस्फेट समूह पर हमला करता है। डीएनए इस दोष से ग्रस्त नहीं है और इस प्रकार उच्च पीएच में उल्लेखनीय स्थिरता प्राप्त करता है।
क्षारीय लसीका
आणविक जीवविज्ञानी अक्सर प्लास्मिड डीएनए को बैक्टीरिया से अलग करने के लिए क्षारीय विकृतीकरण का उपयोग करते हैं। प्लाज्मिड्स बैक्टीरिया के गुणसूत्र से अलग डीएनए के छोटे छोरों हैं। एक क्षारीय लसीक मिनीप्रेप में, जीवविज्ञानी घोल में निलंबित बैक्टीरिया में डिटर्जेंट और सोडियम हाइड्रॉक्साइड मिलाते हैं। डिटर्जेंट बैक्टीरिया सेल झिल्ली को भंग कर देता है जबकि सोडियम हाइड्रोक्साइड पीएच को बढ़ा देता है और घोल को अत्यधिक क्षारीय बना देता है। जैसे ही टूटी हुई कोशिकाएं अपनी सामग्री छोड़ती हैं, अंदर का डीएनए उसके घटक किस्में, या निरूपण में अलग हो जाता है।
Reannealing
एक बार जब जीवविज्ञानी कोशिका से डीएनए निकालता है, तो वह एक और अभिकर्मक को एक और तटस्थ पीएच में जोड़ता है और डिटर्जेंट को अवक्षेपित करता है। पीएच में परिवर्तन बेरहम किस्में को दुबारा करने की अनुमति देता है; भारी गुणसूत्र, हालांकि, ऐसा नहीं कर सकते हैं, इसलिए जीवविज्ञानी इसे डिटर्जेंट, डिनैटेड प्रोटीन और अन्य मिश्रित कबाड़ के साथ एक साथ निकाल सकते हैं, पीछे प्लास्मिड छोड़ सकते हैं। क्षारीय लसीक पूरी तरह से प्लास्मिड डीएनए को शुद्ध नहीं करता है; बल्कि, यह सेल से निकालने और अधिकांश अन्य दूषित पदार्थों को हटाने के लिए "त्वरित और गंदे" तरीके के रूप में कार्य करता है।