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हालाँकि, प्राकृतिक शक्तियाँ किसी पशु की आबादी को नष्ट या तबाह कर सकती हैं, लेकिन मनुष्य की गतिविधियों ने बड़ी संख्या में जानवरों को संकटग्रस्त कर दिया है। निश्चित रूप से कुछ जानवरों और पौधों, विशेष रूप से पालतू जानवरों जैसे फसलों, पशुधन और पालतू जानवरों को लाभ हुआ है और यहां तक कि मनुष्य द्वारा दुनिया में किए गए परिवर्तनों से भी पनपा है। हालांकि, कुछ जानवरों की आबादी को इन परिवर्तनों के परिणामस्वरूप काफी दबाव में रखा गया है और, कुछ मामलों में, आबादी काफी निचले स्तर तक गिर रही है। सीमित वितरण वाली छोटी आबादी या जीव खतरे के कारण कारकों के प्रति बेहद संवेदनशील होते हैं, चाहे वह शब्द के सामान्य ज्ञान पर निर्भर हो या संघीय कानून में लुप्तप्राय प्रजातियों की परिभाषा।
घर का खोना
लुप्तप्राय जानवरों के सबसे महत्वपूर्ण कारणों में से एक निवास स्थान का नुकसान है। जबकि प्राकृतिक बलों (जलवायु परिवर्तन, भूगर्भीय परिवर्तन) के कारण निवास स्थान खो सकता है, आज के निवास स्थान का अधिकांश भाग मानव गतिविधि के कारण है। बांधों, राजमार्गों, नहरों, शहरीकरण और कृषि का निर्माण मूल रूप से मूल पारिस्थितिक तंत्र के निवासियों को प्रभावित करता है। यहां तक कि जब पारिस्थितिकी तंत्र के हिस्से "द्वीपों" का निर्माण करते हैं, तो परिणामस्वरूप निवास स्थान बहुत छोटा हो सकता है या एक प्रजाति का समर्थन करने के लिए व्यापक रूप से फैल सकता है।
हमलावर नस्ल
आक्रामक प्रजातियां जानवरों के लुप्तप्राय होने के प्रमुख जैविक कारणों में से एक हैं। एक नए पारिस्थितिकी तंत्र में पहुंचने वाली कई प्रजातियां बीमार हैं और जल्दी से मर जाती हैं। हालांकि, कुछ प्रजातियां देशी जीवों की रक्षा के लिए पारिस्थितिकी तंत्र का शोषण करने में सक्षम हैं। द्वीपों पर छोटे पारिस्थितिक तंत्र आक्रामक प्रजातियों की शुरूआत से काफी प्रभावित होते हैं, लेकिन यहां तक कि देशी महाद्वीपीय और महासागरीय आबादी को हमलावर द्वारा प्रतिस्पर्धा या भविष्यवाणी के माध्यम से तबाह किया जा सकता है।
संसाधनों की अधिकता
एक विशेष मछली की प्रजाति को खत्म करना एक जानवर के लुप्तप्राय होने का एक स्पष्ट और प्रत्यक्ष कारण है। लेकिन पारिस्थितिकी तंत्र के भीतर अन्य जीवों को भी किसी विशेष प्रजाति के अतिप्रयोग से नुकसान (या लाभ) हो सकता है। उदाहरण के लिए, चिंता का विषय है कि कैलिफ़ोर्निया समुद्री ओटर अबलाओं की आबादी को तबाह कर रहा था, जिससे समुद्री जीवों की अंधाधुंध हत्या हो रही थी, जिससे कई जीवों के बीच जैविक प्रतिस्पर्धा का संतुलन बदल गया था। समुद्री ऊदबिलाव की कमी के कारण समुद्री अर्चिनों की आबादी में एक विस्फोट हुआ, जो केल्प के उपवास पर टिका हुआ था। जैसे ही केलप नीचे से मुक्त हुआ और राख से धोया गया, केलप जंगलों पर निर्भर रहने वाले जीवों को बढ़े हुए तनाव के तहत रखा गया।
रोगजनकों और रोग
पालतू जानवरों के प्रसार ने उनके साथ जुड़े रोगों को भी दुनिया के नए क्षेत्रों में फैला दिया है। कुछ मामलों में, बीमारियों ने देशी आबादी को संक्रमित किया, जिसमें हमलावर रोगज़नक़ों के लिए बहुत कम प्रतिरोध था। ये रोग मूल आबादी में महामारी के स्तर तक पहुंच सकते हैं, उनकी संख्या को कम कर सकते हैं।
पर्यावरण प्रदूषण
कई रूपों में प्रदूषण ने कई जानवरों को खतरे में डाल दिया है। एक पारिस्थितिकी तंत्र के लिए शुरू किए गए कीटनाशकों और अन्य रसायनों से असत्य प्रजातियों को काफी नुकसान पहुंच सकता है। उदाहरण के लिए, मच्छरों से लड़ने के लिए इस्तेमाल किए जाने वाले डीडीटी को अंततः पक्षियों की प्रजनन दर में गिरावट से जोड़ा गया। प्रदूषण के अन्य प्रकार जैसे कि थर्मल, प्रकाश और ध्वनि प्रदूषण प्रत्येक स्थानीय पशु आबादी की जीवित रहने की दर को कम कर सकते हैं।